Extremadura puso en marcha sus relaciones de cooperación con Portugal a raíz de la firma, en 1992 y en 1994, respectivamente, de sendos Protocolos de Cooperación con las regiones portuguesas vecinas del Alentejo y Centro. En estos Protocolos se establecía una estructura de cooperación básica que permitió institucionalizar las relaciones transfronterizas.

EL GIT es un proyecto aprobado por el Programa Operativo de Cooperación Transfronteriza España-Portugal (POCTEP) y financiado por la UE a través del FEDER. Se estructura en tres núcleos, uno en Mérida, dependiente de la Junta de Extremadura, y los otros dos en Évora y Coimbra, tutelados, respectivamente, por las Comisiones de Coordinación y Desarrollo Regional de Alentejo y Centro. Las tres oficinas cuentan con presupuesto y personal propio y trabajan de modo coordinado para la consecución de sus fines.

Desde 2009, año en el que se constituye la eurorregión Alentejo-Centro-Extremadura, el GIT actúa como Secretariado de la eurorregión y tiene como funciones asegurar el funcionamiento operativo de la comunidad de trabajo y la dinamización de la cooperación transfronteriza entre las tres regiones.

1. Estimular todo tipo de relaciones y proyectos de cooperación entre Extremadura y Portugal, poniendo en contacto y asesorando a los actores de uno y otro lado de la frontera.

2. Coordinar, asesorar y prestar apoyo técnico y de secretariado a los grupos de trabajo de composición tripartita que operan en el marco de las estructuras diseñadas por los Protocolos de Cooperación.

3. Realizar la función de Secretariado de la Eurorregión Alentejo-Centro-Extremadura (EUROACE).

4. Organizar directamente o prestar apoyo técnico y financiero para la realización de jornadas y seminarios sobre temas específicos, cursos de portugués, encuentros de empresarios, exposiciones artísticas y, en general, cualquier proyecto de interés para el cumplimiento de sus fines.

5. Promover y apoyar de manera especial la celebración de intercambios entre escolares portugueses y españoles, fomentando desde la primera infancia la convivencia entre los jóvenes como pieza fundamental para favorecer el conocimiento, entendimiento y respeto mutuo.

6. Editar y difundir publicaciones sobre temas que afecten a las relaciones entre Extremadura y Portugal.